平成１１年１１月から当院の集学治療病棟の拡充に伴い、急性期脳卒中を集学的に迅速に診断と治療を行う脳卒中ケアユニット(Stroke Care Unit: SCU)を国立大学としては全国に先駆けて開設し、平成１８年１１月には正式な脳卒中センターとして稼働開始しています。これは脳神経外科、神経内科、放射線科、集学治療部、循環器科、リハビリテーション部門が中心となって、恊働での治療を行うもので、月２０−２５人の脳卒中患者さんが緊急入院しています。放射線科医師や技師さんたちの熱意により、夜中でもCT検査やMRI検査を撮影することができ、正確な診断が２４時間いつでも可能となっています。ちなみにMRIは3.0テスラという、日本でもまだ数少ない最高機種が導入されています。CTスキャンは16列マルチデイテクター搭載型が３台稼働しています。血管撮影装置もPhilips社製の3D撮像可能な最新マシーンに加え、2005年3月からは新しくSiemens社製の血管撮影装置を2台稼働させていますので、合計３台が使用できます。このように、日本はもとより世界でもトップクラスの画像診断が可能となっています。
　脳動脈瘤破裂によるくも膜下出血や、脳梗塞に対しても、通常の内科的治療はもちろん、最新機械を駆使しながら、切らずになおす血管内治療を提供できる環境にあります。また頸動脈狭窄症に対する頸動脈内膜剥離術も精力的に行っており、良い治療成績をあげています。また2005年10月からは、脳梗塞を発症して早い時間であれば、血栓を溶かす薬(tPA)を点滴から流す治療ができるようになり、従来の血管内治療に加え、急性期からより積極的な治療を取り入れています。
　脳腫瘍に関しても、県内外からの紹介患者さんを広く受けいれており、神経膠腫、下垂体腺腫、髄膜種、神経鞘腫、転移性脳腫瘍などの治療を行っています。腫瘍に対する放射線治療は通常の方法以外にも、X knifeという集中的にその部位だけに放射線をあてる方法や、中性子捕捉療法という特殊な方法でも行っています。また胚細胞種や悪性リンパ腫などに対する化学療法も積極的に行っております。手術器具も充実しており、最新型の顕微鏡、ナビゲーションシステム、高性能ドリル、超音波スカルペル、CUSA、レクセル定位脳手術装置などがそろっています。
　顔面けいれん、三叉神経痛は数多く手術経験があり、永廣教授の個人的な手術件数は日本でもトップクラスです。高い成功率をおさめ、患者さんの福音となっています。
　脊椎脊髄疾患に対しても、最近では手術が必要な患者さんを県内から広く受け入れ、年間約４０件程度手術を行っています。頸椎疾患だけでなく、腰痛の患者さんや手根管症候群、脊髄腫瘍、脊髄血管障害の患者さんの診療もしています。
　また当院救急部（集学治療部）にも脳神経外科医師を常時派遣し、急性期脳卒中以外の脳神経疾患救急患者に24時間対応しています。